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  • MAG-MS-GDNA 多样本基因组DNA提取试剂盒

    产品货号: MAG-MS-GDNA-50,MAG-MS-GDNA-250

    产品规格: 50 rxns、250 rxns

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产品概述:

产品货号:MAG-MS-GDNA-50,MAG-MS-GDNA-250

产品规格:50 rxns、250 rxns

运输条件:常温运输

保存条件:PK Soln 2-8℃保存12个月,-20℃长期保存,其它组分室温保存12个月。

应用范围:抗凝全血或血液白膜层、唾液、含保存液拭子、干拭子/棉签、干血斑、动物组织、培养 细胞、FFPE、指甲或头发、革兰氏阴性菌。

产品组分

组分

MAG-MS-GDNA-50

MAG-MS-GDNA-250

MB Mix

0.75 mL

3.75 mL

PK Soln

1.25mL

6.25mL

Buffer ATL*1

20 mL

100 mL

Buffer AL

20 mL

100 mL

Buffer DW1

50 mL

250 mL

Buffer DW2 (concentrate)*2

15 mL

75 mL

Buffer EB

5 mL

25 mL

*注:

1)若使用前Buffer ATL有沉淀,需在56℃下温育溶解后使用;

2)Buffer DW2为浓缩溶液,使用前请按照瓶身标签提示加入无水乙醇进行稀释。

产品介绍

本制品适用于从多种类型样本中提取DNA,如:全血或血液白膜层、唾液、含保存液拭子、干拭子/棉签、干血斑、动物组织、培养细胞、FFPE等样本。试剂盒采用了磁性纳米颗粒固相核酸富集技术,精选高性能纳米磁珠,配合精心研制的Buffer体系组合而成。提取所得的DNA产物可直接用于PCR、qPCR、芯片分析、NGS等各种下游分子生物学实验。

适用仪器

适用于基于磁转移技术的32位或96位核酸提取仪。如BIO-DL 32,TIANGEN TGuide S32,TIANLONG NP968-C,Rosetta 96等自动化核酸提取仪,也适用于手动提取。

操作步骤

一.首次使用前:

1.样本前处理步骤,若使用水浴锅进行裂解,期间需将内容物颠倒混匀2~3次;若使用恒温振荡器裂解,建议设置振荡速度为1000~1500 rpm;

2. Buffer DW2使用前需按照试剂瓶标签提示加入无水乙醇进行稀释后使用;

3.建议使用Buffer DW1清洗2次,可改善所得DNA纯度。

4.自备试剂:异丙醇(AR)、无水乙醇(AR)

二.样本前处理

A.   抗凝全血或血液白膜层

1.   向2 mL离心管中加入25 μL PK Soln。

2.   加入250 μL抗凝全血样本至上述离心管。

注:禽类抗凝血液,取10~15 μL并加入去离子水补足至250 μL,再进行下一步实验。

3.   加入250 μL Buffer AL,高速涡旋10秒,于70℃振荡温浴15分钟。短暂离心后 冷却至室温。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

B.   新鲜唾液、含保存液的唾液或含保存液拭子

1.   向2 mL离心管中加入25 μLPK Soln。

2.   加入300μL新鲜唾液样本(或唾液/保存液混合液、充分涡旋的拭子/保存液混合液 样本)至上述离心管。

3.   加入300μL Buffer AL,高速涡旋10秒,于70℃振荡温浴15分钟。短暂离心后 冷却至室温。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

C.   干拭子/棉签样本

1.   转移采集完细胞的干拭子(或棉签)至2 mL离心管中,加入25 μLPK Soln。

2.   加入400 μL Buffer ATL,高速涡旋10秒,于58℃振荡温浴30分钟。

3.   加入400 μL Buffer AL,涡旋混匀,于70℃振荡温浴10分钟,10,000×g离心1分钟后,吸取600 μL上清液转移至新的2 mL离心管中。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

D.   干血斑(DBS)

1.   转移3~10片3×3 mm尺寸的干血斑(或1~4片6×6 mm尺寸的干血斑)至2 mL离心管中,加入25 μL PK Soln。

2.   加入400 μL Buffer ATL,高速涡旋10秒,于58℃振荡温浴30~60分钟。

注:剧烈振荡对干血斑样本中DNA释放是有利的,建议在1,500 rpm下进行操作,陈旧血卡、动物血卡、过量血卡可适当延长裂解时间。

3.   加入400 μL Buffer AL,涡旋混匀,于70℃振荡温浴10~15分钟。10,000×g离心1分钟后,吸取600 μL上清液转移至新的2 mL离心管中。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

E.    动物组织

1.   转移小于30 mg动物组织至2 mL离心管中,加入25 μL PK Soln。

2.   加入300μL Buffer ATL,高速涡旋10秒。58℃振荡温浴30~60分钟或延长时间至完全消化样本。(如果需要去除RNA,加入2~4 µL RNaseA(100 mg/mL)室温放置10分钟以降解RNA)。

注1:对于不易消化的组织样本,可延长消化时间至消化完全;若存在长时间未能消化完全的物质,可10,000×g离心1分钟,然后转移上清液至新的2 mL离心管中。

注2:对于骨头和牙齿,需要先液氮研磨成粉末,取100 mg粉末进行实验,需延长消化时间。

3.   加入300μL Buffer AL,涡旋10秒混合均匀。

注:对于不易裂解的组织样本且希望获得更好的DNA质量,需继续在70℃下裂解10分钟;对于组织量少且较易裂解的组织样本,无需该70℃裂解步骤。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

F.   培养细胞

1.   取一定量的细胞样本(<5×106 cells)置于2 mL离心管中,1,000×g离心5分钟收集细胞,小心弃去上清液。

2.   加入25 μL PK Soln和300μL PBS缓冲液,涡旋打散细胞。

3.   加入300μL Buffer AL,涡旋10秒,于70℃振荡温浴15分钟。短暂离心后,冷却至室温。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

G.    FFPE

1.   将2~8张石蜡切片(厚度5~10 μm)转入2 mL离心管中,用二甲苯或代替物脱除石蜡,然后用无水乙醇清洗干净,烘干。

2.   加入25 μL PK Soln和300μL Buffer ATL,高速涡旋10秒,于58℃振荡温浴30~60分钟或至样本完全裂解。

3.   将离心管置于90℃下温浴60分钟(此步骤无需振荡)。短暂离心后冷却至室温。

4.   向离心管中加入300μL Buffer AL、350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

H.    指甲、头发和羽毛

1.   转移10~25 mg指甲、头发或羽毛样本至2 mL离心管中。

注:指甲样本尽量剪成小片;头发样本从发根部剪下0.5~1 cm数根;羽毛样本剪下1~5 cm长并剪短;精斑样本取<0.5 cm2;精液样本吸取100 μL。

2.   加入25 μL PK Soln、20 μL 1M DTT和300μL Buffer ATL,高速涡旋10秒后,于58℃振荡温浴30~60分钟或延长时间至完全消化样本。

注:对于毛发样本,通常1小时即可达到基本消化;对于指甲样本,无需等待指甲完全消化,通常1~6小时后即可吸取消化液进行下一步实验;精斑&精液样本至少消化1小时。

3.   加入300μL Buffer AL,涡旋10秒。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix ,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

I.    革兰氏阴性菌

1.   取一定量的细菌培养液1~5 mL(<2×109 cells)10,000×g离心1分钟,小心弃去上清液。

2.   加入25 μL PK Soln和300μL Buffer ATL至上述离心管。涡旋10秒后,于58℃振荡温浴30分钟。

3.   加入300 μL Buffer AL,涡旋10秒。

注:对于大量细菌,可继续在70℃下裂解10分钟;对于少量细菌,则无需该70℃裂解步骤。

4.   向离心管中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix,涡旋振荡5~10分钟。按【纯化步骤】继续进行后续操作。

三.纯化步骤:手动法

5.   短暂离心,将离心管内液体收集至底部,然后将离心管置于磁力架上静置30秒。

待磁珠完全吸附后,用移液器吸弃管内液体。

6.   向离心管中加入700 μL Buffer DW1,1,000 rpm涡旋振荡2~3分钟,磁性分离,吸弃上清液。

注:如对核酸产物纯度要求较高,该步清洗方案可变更为使用500 μL Buffer DW1清洗2次,可获得更优的A260/280和A260/230数值。

7.   向离心管中加入700 μL Buffer DW2(已用乙醇稀释),1,000 rpm涡旋振荡2~3分钟,磁性分离,吸弃上清液。

8.   重复上述步骤7一次。

9.   将离心管继续保持在磁力架上,放入45~50℃烘箱中,干燥约10分钟至无明显乙醇气味(也可室温晾干,但需要更长时间)。

10.  挥发除醇结束后,向离心管中加入50~100 μL Buffer EB,吹散或振散磁珠,58℃振荡温浴5~10分钟。磁性分离,将洗脱液转移至另一干净离心管中,得DNA产物,保存于-20℃。

四.纯化步骤: 96位核酸提取仪

1.    将Sample Plate中加入350 μL异丙醇和15 μL MB Mix(可预先混合);

2.    在Sample Plate中加入相应体积的不同样本的裂解上清液;

3.    将96位磁棒套放入到Wash 3 Plate中(必须准确放入,否则可能损坏磁棒套。此步骤为针对King Fisher Flex,若使用其它品牌仪器请做相应调整)。

4.    将试剂板按对应顺序放入核酸提取仪中,运行程序。

5.    程序运行完毕,转移Elute Plate中DNA至新离心管中,提取过程结束。

注:长时间保存建议将DNA产物保存于-20℃环境。

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